


主办单位:莫速乎科研教育(上海莫速乎教育投资有限公司)
活动内容
肿瘤公开数据库SEER数据库挖掘分析专题会议
2020/8/1-2 网络精讲班
SEER数据库近年发文呈现直线上升趋势。SEER数据库全名(Surveillance, Epidemiology, and End Results ),是美国权威的癌症统计数据库,SEER临床公共数据库已成为肿瘤领域数据挖掘的热点。对于已经工作的临床医师或者实验室的同学们,省去收集数据的过程,通过阅读文献或实际工作中发现问题。在SEER数据库获取数据、转换数据后,再从临床医师的角度出发,通过现成的代码简化繁琐统计过程,运用临床思维来分析问题,撰写文章。同时对于有基础的同学,通过对顶级期刊SEER数据库文献的还原,体验高质量的临床研究的思路与方法,并模仿并提升自己临床课题质量。
会议预期
1. 通过两整天学习,掌握SEER数据库的使用、下载及数据分析思路和实用操作知识点。
2. 对于零基础学员可以独立完成一篇基于SEER数据库的数据挖掘文章(SCI)。
3. 对于有基础的学员通过对顶级期刊上SEER数据库的文章还原,提供更深刻的理解与认识,争取实现SEER数据库高分文章的发表。
日期 |
时间 |
课程安排 |
内容介绍 |
第一天 |
8:30-10:00 |
国外公共数据库简介 |
NIH简介 |
介绍国外肿瘤流行病学常发文的数据库(包括SEER等其他公开数据库) |
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经典SEER数据库文章的思路解读,了解SEER数据库的挖掘并获得创新结论并发文章的思路 |
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临床研究的设计—PICO原则 |
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10:00-10:15 |
茶歇 |
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10:15-12:00 |
SEER数据库 |
SEER数据库的申请与注册 |
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Seerstat下载与安装 |
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SEER数据库的数据下载、变量清洗 |
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R语言简介, R studio安装, 代码运行查错技巧 |
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12:00-13:30 |
午餐及午休 |
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13:30-15:00 |
基础课程(R语言基础与基于R语言的简单统计) |
临床病理资料的基线分析:卡方检验与T-检验(及其扩充) |
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逻辑回归、Cox回归、KM曲线、Nomogram建模 |
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15:00-15:20 |
茶歇 |
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15:20-17:00 |
进阶课程 |
竞争风险模型 |
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真实世界研究中倾向得分匹配( propensity score matched)的种类与 运用 |
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多元发肿瘤、泛肿瘤、Jointpoint分析 |
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第二天 |
8:30-10:30 |
SEER数据库实战 (案例一,PSM在真实世界的研究 |
设置案例,学生尝试分析,老师复盘并实操案例。 |
10:30-10:45 |
茶歇 |
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10:45-12:00 |
SEER数据库实战 (案例二,多元发肿瘤在流行病学的研究 |
设置案例,学生尝试分析,老师复盘并实操案例。 |
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12:00-13:30 |
午餐及午休 |
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13:30-15:00 |
SEER数据库实战 (案例三,复盘顶级期刊的SEER数据库文章 |
精读顶级期刊(JAMA Surgery, JCO)上发表的SEER数据库文章 请提前阅读文章以便理解与交流 (PMID:26039049; PMID:26834064) |
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15:00-15:20 |
SEER数据库实战 (案例三,复盘顶级期刊的SEER数据库文章) |
重现顶级期刊(JAMA Surgery, JCO)上发表的SEER数据库文章 关键词:Multiple imputation, propensity score-weighted Cox proportional hazards models, interaction effect, sensitivity analyses 请提前阅读文章以便理解与交流 (PMID:26039049; PMID:26834064) |
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15:20-16:30 |
答疑与展望 |
介绍其他公开的肿瘤相关数据库(暂时保密) |
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注意事项:学员需自己带电脑,要求为windows系统,现场不得录音录像,上课所用软件为Heml |
会议嘉宾(最终出席嘉宾以会议现场为准)
讲师简介:Leo博士,长期聚焦于肿瘤临床研究,常年与国外学者合作挖掘公共数据库,对肿瘤流行病学、真实世界研究有丰富的经验。擅长R语言,统计学,ggplot可视化等技能。目前共发表SCI 20余篇,其中第一作者或通讯作者10余篇,担任多个期刊审稿人。使用SEER数据库发表多篇Q1区SCI,其中单篇最高影响因子7.2分。
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