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肿瘤公开数据库SEER数据库挖掘分析专题会议

已闭幕
活动时间
2020-08-01 08:30:00~2020-08-02 17:00:00

组织单位

主办单位:莫速乎科研教育(上海莫速乎教育投资有限公司)

活动详情

活动内容
肿瘤公开数据库SEER数据库挖掘分析专题会议
2020/8/1-2 网络精讲班


SEER数据库近年发文呈现直线上升趋势。SEER数据库全名(Surveillance, Epidemiology, and End Results ),是美国权威的癌症统计数据库,SEER临床公共数据库已成为肿瘤领域数据挖掘的热点。对于已经工作的临床医师或者实验室的同学们,省去收集数据的过程,通过阅读文献或实际工作中发现问题。在SEER数据库获取数据、转换数据后,再从临床医师的角度出发,通过现成的代码简化繁琐统计过程,运用临床思维来分析问题,撰写文章。同时对于有基础的同学,通过对顶级期刊SEER数据库文献的还原,体验高质量的临床研究的思路与方法,并模仿并提升自己临床课题质量。


会议预期
1. 通过两整天学习,掌握SEER数据库的使用、下载及数据分析思路和实用操作知识点。
2. 对于零基础学员可以独立完成一篇基于SEER数据库的数据挖掘文章(SCI)。
3. 对于有基础的学员通过对顶级期刊上SEER数据库的文章还原,提供更深刻的理解与认识,争取实现SEER数据库高分文章的发表。

日期

时间

课程安排

内容介绍

第一天

8:30-10:00

国外公共数据库简介

NIH简介

介绍国外肿瘤流行病学常发文的数据库(包括SEER等其他公开数据库)

经典SEER数据库文章的思路解读,了解SEER数据库的挖掘并获得创新结论并发文章的思路

临床研究的设计—PICO原则

10:00-10:15

茶歇

10:15-12:00

SEER数据库

SEER数据库的申请与注册

Seerstat下载与安装

SEER数据库的数据下载、变量清洗

R语言简介, R studio安装, 代码运行查错技巧

12:00-13:30

午餐及午休

13:30-15:00

基础课程(R语言基础与基于R语言的简单统计)

临床病理资料的基线分析:卡方检验与T-检验(及其扩充)

逻辑回归、Cox回归、KM曲线、Nomogram建模

15:00-15:20

茶歇

15:20-17:00

进阶课程

竞争风险模型

真实世界研究中倾向得分匹配( propensity score matched)的种类与

运用

多元发肿瘤、泛肿瘤、Jointpoint分析

第二天

8:30-10:30

SEER数据库实战

(案例一,PSM在真实世界的研究

设置案例,学生尝试分析,老师复盘并实操案例。

10:30-10:45

茶歇

10:45-12:00

SEER数据库实战

(案例二,多元发肿瘤在流行病学的研究

设置案例,学生尝试分析,老师复盘并实操案例。

12:00-13:30

午餐及午休

13:30-15:00

SEER数据库实战

(案例三,复盘顶级期刊的SEER数据库文章

精读顶级期刊(JAMA Surgery, JCO)上发表的SEER数据库文章

请提前阅读文章以便理解与交流 (PMID:26039049; PMID:26834064)

15:00-15:20

SEER数据库实战

(案例三,复盘顶级期刊的SEER数据库文章)

重现顶级期刊(JAMA Surgery, JCO)上发表的SEER数据库文章

关键词:Multiple imputation, propensity score-weighted Cox

proportional hazards models, interaction effect, sensitivity analyses

请提前阅读文章以便理解与交流 (PMID:26039049; PMID:26834064)

15:20-16:30

答疑与展望

介绍其他公开的肿瘤相关数据库(暂时保密)

注意事项:学员需自己带电脑,要求为windows系统,现场不得录音录像,上课所用软件为Heml

品牌嘉宾

会议嘉宾(最终出席嘉宾以会议现场为准)
讲师简介:Leo博士,长期聚焦于肿瘤临床研究,常年与国外学者合作挖掘公共数据库,对肿瘤流行病学、真实世界研究有丰富的经验。擅长R语言,统计学,ggplot可视化等技能。目前共发表SCI 20余篇,其中第一作者或通讯作者10余篇,担任多个期刊审稿人。使用SEER数据库发表多篇Q1区SCI,其中单篇最高影响因子7.2分。

联系方式
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